上海公司进出口权备案流程如下：

申请备案登记：企业向上海的海关或相关贸易管理部门提交进出口备案登记申请，提供公司的基本信息和进出口贸易项目信息。

完善备案材料：企业提交申请后，需要完善相应的备案材料。通常需要准备的材料包括企业的营业执照副本、组织机构代码证副本、税务登记证副本等，以及进出口商品的相关文件。

材料审核和审批：相关部门将对提交的材料进行审核，以确保企业提供的信息和文件的真实性和合规性。审核周期可能因企业所属行业和备案项目的不同而有所差异，企业需要耐心等待。

领取备案证书：一旦备案材料通过审核并获得审批，企业可以前往相关部门领取进出口备案证书。该证书是企业进行进出口贸易的合法凭证，具有很高的重要性。

在办理过程中，需要注意以下几点：

资质要求：根据不同的行业和贸易方式，可能需要特定的资质才能进行进出口备案。企业在申请前应了解相关要求，并确保自己具备相应资质。

及时更新备案信息：企业在备案后，如有任何信息变更或贸易项目调整，应及时通知相关部门并提交变更申请。

合规性检查：备案申请中提供的文件和信息必须真实、准确、合规。相关部门会对备案材料和信息进行严格的审核，若发现任何不符合规定的情况，可能导致备案申请被驳回或备案证书被撤销。

以上流程仅供参考，实际流程请以相关部门的具体要求为准。